Duke dan Ripcord, dua tentara biasa, tiba-tiba terjebak dalam misi global ketika hulu ledak nanomite yang mereka kawal diserang oleh organisasi teroris Cobra. Diselamatkan oleh tim elit G.I. Joe, mereka dilatih untuk bergabung dengan para pahlawan ini—termasuk ninja bisu Snake Eyes—guna menggagalkan rencana Destro dan Cobra yang ingin menguasai dunia. Dengan teknologi canggih dan pengkhianatan di setiap sudut, pertarungan ini bukan sekadar perang, tapi pertempuran untuk masa depan umat manusia. Siapakah yang akan menang?
